Conducerea SNSIM este asigurată de următoarele structuri:
- Organul de conducere – Adunarea Generala a SNSIM (alcătuit din totalitatea membrilor)
- Organul executiv – Consiliul Director al SNSIM (alcătuit din 5 membri)
- Organul de reprezentare – Președintele și Vicepreședintele SNSIM